
秘密森林是游戏中可持续获取硬木的重要场景,其位置在煤矿森林左上角的过图点,要想进入秘密森林至少要将斧子工具升级到钢斧头,所需要的材料是有着五个铜锭和五个铁锭。普通斧子首次升级是需要铜锭升级为铜斧子,之后才能通过铁锭把铜斧升级为钢斧,每次升级需要三天,斧子升级的优先级也是比较高的,与浇水的水壶相比,斧子的使用也不是必须的,在升级前确保囤够后面几天所需要的木材,就可以把斧子送去升级。

有了钢斧子就可以来到秘密森林的入口,将挡路的大圆木砍伐,同样是能得到一些硬木,之后秘密森林就是永久开放的状态。秘密森林会生成对应季节的采集物,有很多野外无法采集到的物品都是能在秘密森林里找到。春季除了有着野山葵还有羊肚菌和普通蘑菇,夏季蕨菜的生成率是会更大,此外还会有红蘑菇出现。秋季有着大量的普通蘑菇、鸡油菌以及红蘑菇,到了冬季则是能在这里采摘到冬青树。除了鸡油菌其他的物品,也都是玩家选择社区中心修复路线后,收集包所需要的采集品,蘑菇类物品还是制作生命药水所需的原料。秘密森林中会随着季节的变化出现攻击玩家的史莱姆,也只有这里的史莱姆在击败后有概率掉落桃花心木种子。秘密森林中有着六个可再生的大树桩,用铜品质以上的斧子可以砍伐,每个树桩能掉落2硬木以及一些采集经验,这里的大树桩也是有着相同概率能掉落桃花心木种子,在采集职业中如果选择了护林人,砍掉大树桩后是有一定概率额外得到一个硬木。
很多玩家在进入秘密森林中时,都能找到很显眼的四个大树桩,在砍掉后第二天再生位置也是一样的,另外两个树桩的位置对于新手来说并不是那么容易找到,玩家需要穿过隐藏的小路,在入口处的大树桩下方的灌木丛往右的地块,就可以找到向下走的路,之后向左移动再向下就能进入隐藏的区域,在这里也是有着固定的两个大树桩。在阅读了秘密纸条#23后,就会接到一个奇怪纸条的任务,任务需要玩家带上枫糖浆前往秘密森林,在一段剧情动画结束后就能完成任务,同时获得“熊的知识”让玩家售卖黑莓和大树莓的价格能有所提升。秘密森林中也会刷新远古斑点,用锄头即可挖出里面的物品,不过这里的远古斑点是无法挖到古物,在不同季节里能挖到的物品也都是不一样的。秘密森林不属于村民的活动路径,所以玩家可以在这里放置各种生产设备,也不用担心会被村民毁掉。
秘密森林的最深处还有着一个池塘以及雕像,老坎诺利大师雕像可以互动对话,提示着玩家要交付一个最甜的物品,在星露谷中宝石甜莓则是雕像所需要的,在送出之后则是能得到游戏内最稀有的星之果实,为角色提升永久的体力上限。